Universitas Atma Jaya Yogyakarta (UAJY) ialah salah satu perguruan tinggi katolik terkemuka di Indonesia. Di jenjang S1, UAJY memiliki sejumlah program studi populer.

1. Fakultas Teknik
   1. Teknik Sipil Akreditasi A
   2. Teknik Sipil Internasional Akreditasi A
   3. Teknik Arsitektur Akreditasi A
2. Fakultas Ekonomi
   1. Manajemen Akreditasi A
   2. Manajemen Internasional Akreditasi A
   3. Akuntansi Akreditasi A
   4. Akuntansi Internasional Akreditasi A
   5. Ilmu Ekonomi Akreditasi A
3. Fakultas Hukum
   1. Ilmu Hukum Akreditasi A
4. Fakultas Teknobiologi
   1. Biologi Akreditasi A
5. Fakultas Teknologi Industri (FTI)
   1. Teknik Industri Akreditasi A
   2. Teknik Industri Internasional Akreditasi A
   3. Teknik Informatika Akreditasi A
6. Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik (Isipol)
   1. Komunikasi Akrediasi A
   2. Sosiologi Akreditasi A

Bagi mahasiswa yang berprestasi dan atau yang dinilai mempunyai kesulitan dalam membayar biaya studi karena kemampuan ekonomi keluarga kurang, tersedia beberapa beasiswa. Beasiswa tersebut dapat berupa uang saku yang diberikan tiap bulan atau tiap semester dan besarnya bervariasi. Khusus dari Yayasaan Slamet Rijadi berupa bebas uang SPP Tetap dan Variabel yang diberikan per semester. Mulai tahun 2004, beasiswa yang diberikan pada mahasiswa dapat diperoleh mulai pada semester pertama, namun ada tidaknya tetap tergantung pada tawaran yang diberikan oleh Rekanan UAJY.

Sampai saat ini, beasiswa yang secara rutin diberikan a.l. berasal dari :

1. Yayasan Slamet Rijadi (penyelenggara UAJY) yang berupa pembebasan Sumbangan Pembinaan Pendidikan (SPP)
2. Beasiswa dari Asosiasi Perguruan Tinggi Katolik Indonesia (APTIK)
3. Yayasan SUPERSEMAR
4. BPPA (Beasiswa Peningkatan Prestasi Akademik) dan BPM (Bantuan Panduan Mahasiswa) Depdiknas
5. PT. Djarum Tbk
6. Yayasan Toyota dan Astra
7. BFI Jakarta
8. ANJF
9. Bank Mandiri
10. Bank BRI
11. BCA
12. Vivere
13. Dan lain-lain (beberapa biaya siswa lain yang diberikan secara insidental dari pribadi, perusahaan ataupun lembaga rekanan UAJY)